这是一道关于政策文件解读的问题，需要我们根据《乡村振兴责任制实施办法》的内容来判断哪个选项的描述是不准确的。
首先，我们梳理一下题目中的关键信息和各选项的内容:
A项:坚持党对农村工作的全面领导，省市县乡村五级书记抓乡村振兴。这与《乡村振兴责任制实施办法》中强调的坚持党对农村工作的全面领导，健全党委统一领导、政府负责、党委农村工作部门统筹协调的农村工作领导体制相符合，且确实提到了五级书记抓乡村振兴的要求，所以A项正确。
B项:中央和国家机关有关部门要以健全城乡融合发展体制为主线深化农村改革。然而，《乡村振兴责任制实施办法》中明确提到的是“中央和国家机关有关部门单位要按照职责分工，加强政策统筹、工作协调、调研督导，及时研究解决乡村振兴难点问题，扎实推动乡村振兴各项任务落实落地”，并特别指出“中央农办负责牵头组织实施乡村振兴责任制并具体负责考核工作，推动建立健全乡村振兴有关具体工作专班，统筹推进重点任务落实，定期组织检查督导”，并未提及“以健全城乡融合发展体制为主线深化农村改革”作为中央和国家机关的主要任务，所以B项描述不准确。
C项:地方政府乡村振兴要把确保粮食和重要农产品供给作为首要任务。这与《乡村振兴责任制实施办法》中提到的“地方政府对本地区乡村振兴工作负主体责任，确保粮食和重要农产品供给，巩固拓展脱贫攻坚成果，全面推进乡村振兴”相符，所以C项正确。
D项:县级党委和政府是乡村振兴“一线指挥部”。这与《乡村振兴责任制实施办法》中强调的“县级党委和政府是乡村振兴‘一线指挥部’”完全一致，所以D项正确。
综上所述，B项“中央和国家机关有关部门要以健全城乡融合发展体制为主线深化农村改革”与《乡村振兴责任制实施办法》的内容不符，是不准确的说法。
因此，答案是B。